Els grups del Parlament creuen en les seves conclusions de la comissió d'investigació sobre frau, evasió fiscal i corrupció que ha servit per veure les causes d'aquests problemes, però no per aclarir casos com el que va donar peu a la seva creació, el cas Pujol, sobre el qual subsisteixen els seus dubtes. L'Oficina Antifrau de Catalunya (OAC), per la seva banda, va advertir sobre la «inadequada relació» entre política i negocis i va lamentar que, després de la comissió d'investigació, encara persistissin les «sospites fonamentades» sobre finançament irregular de partits. En el seu escrit de conclusions, Antifrau conclou que les compareixences de la comissió Pujol han constat que els dèficits en transparència i accés a la informació pública han suposat un «camp adobat per a les pràctiques de corrupció».
CiU, per exemple, considera que no es poden extreure conclusions «prou solvents» respecte al cas de la família Pujol ni els altres tractats a la comissió, encara que en el seu document no fa una referència explícita a aquests. En el document de conclusions de CiU no s'esmenta el cas de l'expresident Jordi Pujol i de la seva família, ni tampoc altres analitzats a la comissió, com el Pretòria, el Bárcenas o el cas Método 3.
