El Club Natació Banyoles, situat al costat de l'Estany, compta des d'ara amb una estació mòbil per desinfectar embarcacions i evitar l'entrada del musclo zebrat i altres espècies invasores a la zona. Fins ara la desinfecció es feia de forma manual però ara es realitzarà des d'un indret específic amb més material tècnic i si cal, es podrà traslladar a altres punts, com ara en el cas de triatlons per desinfectar la roba de neoprè. El musclo zebrat és una espècie exòtica amb una gran capacitat de colonització, tal com s'ha vist en indrets com el riu Ebre, que representa una greu amenaça per l'impacte ambiental i econòmic que comporta. Es propaga a través de larves microscòpiques que podrien estar enganxades a les embarcacions esportives que arriben en aquest espai natural procedents de diferents punts de l'Estat i del món per participar en competicions. És per això que, per prevenció, es feien les desinfeccions a mà. Es calcula que cada any passen unes 800 embarcacions diferents pel Club Natació Banyoles, l'únic punt que tenen per entrar a l'Estany. L'ACA porta analitzant l'aigua de la zona des del 2012 i fins avui no s'ha detectat la presència del musclo zebrat.