El Centre Criptològic Nacional, adscrit al CNI, supervisarà el recompte provisional dels resultats dins d'un pla que s'ha posat en marxa per evitar ciberatacs i la desinformació o «fake news» a les xarxes socials. El CNN ha activat un pla específic amb diverses mesures per evitar ciberatacs, especialment en el procés de recompte provisional, a càrrec de l'empresa Indra, que és un dels moments més crítics que poden alterar els resultats per a deslegitimar el recompte definitiu. Fonts del CNI diuen que el risc de ciberatacs és gairebé nul durant el procés, però sí que podria produir-se en el recompte.
