El Departament de Territori i Sostenibilitat ha destacat el bon funcionament dels emissaris submarins que aboquen al mar l'aigua tractada a les depuradores costaneres. A les comarques de Girona, n'hi ha onze, que es troben a Llançà, Port de la Selva, Nou Platja Gran -emissari vinculat a la depuradora de Cadaqués-, Roses, l'Escala, sa Tuna de Begur, Fornells, Castell -aquest amb aigües depurades a l'EDAR Palamós-, Platja d'Aro, Sa Caravel·la -de l'EDAR de Lloret de Mar- i S'Abanell -de Blanes-.

A Catalunya hi ha operatius 37 emissaris submarins repartits per tot el litoral, segons dades de l'Agència Catalana de l'Aigua: els 11 de Girona, 12 a Barcelona i 14 a Tarragona. La funció de les conduccions submarines és abocar al mar, lluny de la costa, l'aigua degudament tractada a les depuradores dels sistemes de sanejament dels municipis costaners.