El Llagostera no havia jugat mai la Copa fins la temporada 2011/12, gràcies al títol de Tercera assolit una temporada abans. Tot i això, ja ha arribat dues vegades a setzens, cosa que li ha permès jugar contra un Primera. La temporada 2012/13 els va eliminar el València (0-2 a casa i 3-1 a Mestalla); el curs 2015/16, amb l'equip a Segona A, van caure amb el Dépor (1-2 a Palamós i 1-1 a Riazor).